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10x Visium HD 空间基因表达分析将组织学技术的优势与RNA测序的高通量和发现能力融入FFPE组织样本中,可对病理学家主导的传统分析进行补充。它能够以高分辨率(低至2um x 2um)对整张组织切片进行分析,从空间上分析人和小鼠FFPE样本中超过18,000个基因的RNA表达。通过全转录组分析能够检测任何通路中的任何基因,分辨组织异质性,并在形态背景下揭示各种细胞类型和细胞状态的空间分布。
新一代的玻片结构,实现单细胞分辨率
Visium HD的空间基因表达芯片有2个捕获区。每个捕获区域为6.5x6.5mm。捕获区有~1100万个基因表达spot点,每个点包括标记空间位置的Spatial Barcode,以追溯RNA来源位置信息。
FFPE人类结直肠癌样本的Visium v2数据(左)和Visium HD数据(右)的并排比较,展示了在单细胞分辨率下全转录组空间基因表达的发现能力增强。
高清晰度的全转录组空间发现
每微米都蕴藏着无限的探索潜力
目前,10x团队已经完成人和小鼠FFPE样本一些常见类型样本的内测,如人结肠、皮肤,乳腺癌、肺癌、肝癌、前列腺癌等,后续也将会推出针对新鲜组织样本的应用。